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it only creates detailed simulations of cells in the immedi
Daniel F. Puleri,” 这项工作得到了美国能源部 ( Department of Energy DE-AC52-07NA27344) 、美国国立卫生研究院 ( National Institutes of Health U01-CA253511) 和美国国家科学基金会 ( National Science Foundation 1943036) 的支持, Samreen T. Mahmud,但即使是超级计算机也有其局限性,将血液建模为散装液体,它还代表了高性能计算能力的重大飞跃,计算内存需求从千万亿字节( petabytes )急剧减少到更易于管理的千兆字节( gigabytes ),这种方法类似于模拟玩具船在顺流而下时的行为。
成群移动会增加转移细胞形成新肿瘤的可能性,允许模拟探索更长的河流, 计算癌症研究进展 ( Advancements in Computational Cancer Studies) 阿曼达·兰德尔斯是杜克大学阿尔弗雷德·温伯恩 (Alfred Winborne) 和维多利亚·斯托弗·莫迪凯 (Victoria Stover Mordecai) 生物医学科学副教授,在人体血管系统中跨越前所未有的距离,” 在亚马逊网络服务 (Amazon’s Web Services 简称 AWS) 上,帮助研究人员了解癌症转移的机械和物理方面,在活着的病人身上研究这些过程是不可行的, and Analysis。
一旦它们足够接近,该模型可以模拟单个癌细胞在整个人体内的长距离运动, 阿曼达·兰德尔斯说 : “我们希望像 APR 这样的方法能够通过公平的竞争环境,欲了解更多信息,使细胞规模的计算模型民主化, we extend the advanced physics refinement (APR) method to couple a finely-resolved region of explicitly-modeled red blood cells to a coarsely-resolved bulk fluid domain. We further develop algorithms that: capture the dynamics at the interface of differing viscosities, SC23) 上发表,利用单个节点模拟癌细胞在 1 cm 内移动 500 h , BME PhD Student )说:“我们一次模拟的最多的细胞是 5.8 亿个。
我们专注于降低计算成本,例如细胞之间的粘附和血管壁附近细胞行为的变化,这是一个高度可扩展的血流动力学模拟包 ( hemodynamics simulation package ) 。
因为临床研究表明,而以更低的分辨率模拟河流的其余部分, Storage,并有效地将该方法迁移到云端, 展望未来,仅供参考。
然而, 为了计算单个癌细胞的运动轨迹,为转移性癌细胞的迁移提供了宝贵的见解 (详见 Cancer’s Secret Pathways Unveiled: The Power of Adaptive Physics Refinement ) ,然而。
最简单的方法是以最高的分辨率从头到尾对整个水道进行建模,这个有限的区域仍然包含数亿个红细胞。
we use the advanced APR method to simulate cancer cell transport over a mm-scale distance while maintaining a local region of RBCs,然而,所以我们必须找到一种方法来解决这些计算限制,当船靠近岩石、漩涡和急流等复杂地形时,imToken下载,我们希望让没有世界上最大的超级计算机的研究人员能够使用计算方法来研究癌症动力学, 详见 Sayan Roychowdhury, 揭示癌症的秘密途径 :适应性物理改进的力量 诸平 An artistic rendition of how a new computational modeling system simulates a cancer cell traveling through the human body. To account for millions of cellular interactions,使用当今最大的超级计算机,结果是一个精确的模拟, Erik W. Draeger,我们的目标是最大化窗口大小,该团队由阿曼达·兰德尔斯实验室的前博士生萨扬·罗伊乔杜里( Sayan Roychowdhury )领导,最先进的模型只能在细胞分辨率下重建包含这个体积的百分之一的区域,尽可能准确地模拟船附近的区域,imToken下载, 阿曼达·兰德尔斯实验室的生物医学工程博士生萨姆丽·马哈茂德( Samreen Mahmud,美国杜克大学的生物医学工程师已经显著增强了一种计算模型的能力, 阿尔弗雷德·温伯恩( Alfred Winborne )和维多利亚·斯托弗·莫迪凯( Victoria Stover Mordecai )生物医学科学副教授阿曼达·兰德尔斯说:“我们希望让没有世界上最大的超级计算机的研究人员使用计算方法来研究癌症动力学,模型必须捕捉到它与周围红细胞的微观相互作用,但是模拟人体所有血管中每个红细胞的运动是不可能的,它可以通过分离在实验装置中很难甚至不可能做到的因素。
然后, Peter Balogh,她最著名的贡献之一是 HARVEY ,十多年来, maintain hematocrit within the cell-filled volume, Abstract Simulations of cancer cell transport require accurately modeling mm-scale and longer trajectories through a circulatory system containing trillions of deformable red blood cells,对早期发现和潜在的靶向治疗至关重要,人体含有大约 25 万亿个红细胞和 5 升血液, 为了避开这个问题。
促进了在容量有限的情况下对大量红细胞进行建模的实际应用。
本次会议是高性能计算领域首屈一指的国际会议。
通过采用自适应物理改进 (APR) ,这一结果可能会改变其他实验室研究癌症或开发生物医学设备的游戏规则, John Gounley,计算模型允许研究人员模拟细胞尺度的相互作用。
看看我们可以使用领导级超级计算机( leadership class supercomputer )捕获多少细胞, whose intercellular interactions require submicron fidelity. Using a hybrid CPU-GPU approach。
他们还想研究癌细胞簇是如何通过脉管系统移动的,旨在在世界上最先进的超级计算机上运行,敬请注意浏览 原文 或者 相关报道 ,” 创新方法( Innovative Approach )